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Mapeo de superficies para la detección de hot spots microbianos persistentes en la industria alimentaria

En el ámbito de la seguridad alimentaria, uno de los mayores desafíos es identificar y controlar la presencia de patógenos persistentes en las instalaciones de producción. Lejos de ser contaminaciones puntuales, hablamos de poblaciones bacterianas que logran sobrevivir a los procedimientos habituales de limpieza y desinfección, estableciéndose en zonas de refugio que se convierten en hot spots de contaminación crónica.

Pero ¿por qué persisten estos patógenos? Pues bien, las bacterias pueden desarrollar mecanismos fisiológicos y genéticos que les permiten resistir condiciones hostiles. Y es que, por un lado, pueden sobrevivir a concentraciones subletales de desinfectante, que no eliminan completamente la población y, por otro lado, por la formación de biofilms, creando una matriz protectora difícil de penetrar, y de Viable But Non-Culturable, formas VBNC, estados en los que las bacterias no se cultivan en medios tradicionales, pero siguen siendo viables y potencialmente peligrosas. 

Estas estrategias hacen que ciertos microorganismos se conviertan en colonizadores crónicos de zonas de difícil acceso, generando riesgos para la inocuidad de los alimentos

¿Cómo lo buscamos? Metagenómica dirigida al 16S

El mapeo de superficies se basa cada vez más en enfoques moleculares avanzados, que permiten detectar incluso bacterias no cultivables o presentes en baja abundancia. Entre estas técnicas destaca la metagenómica dirigida al gen 16S RNA, que se estructura en seis pasos clave:

•    Muestreo exhaustivo de superficies críticas (zonas húmedas, juntas, drenajes, etc.).
•    Extracción de ADN a partir del material recogido.
•    Preparación de librerías para secuenciación.
•    Secuenciación de alto rendimiento (HTS) que genera millones de lecturas.
•    Clasificación bacteriana que identifica taxones presentes en las muestras.
•    Análisis ecológico para interpretar la estructura y dinámica de la microbiota.
 

Gracias a este enfoque conseguimos detectar patógenos persistentes en muy baja cantidad; visualizar microbiotas resistentes que favorezcan la permanencia de contaminantes; comparar zonas limpias con zonas con contaminación crónica y, por último, orientar medidas correctivas más precisas y basadas en datos
 

La importancia de un buen muestreo: HiEnviro-Sponge™

El éxito de cualquier estrategia depende de la calidad y representatividad del muestreo. En Alco Suministros de Laboratorio trabajamos con las esponjas HiMedia HiEnviro-Sponge™, especialmente diseñadas para el muestreo de superficies:
•    Prehumedecidas y listas para usar
•    Alta capacidad de retención de microorganismos
•    Alta capacidad de arrastre
•    Adecuadas para superficies lisas, rugosas y zonas de difícil acceso
•    Compatibles con análisis microbiológicos 
 

Estas esponjas permiten capturar mejor la diversidad microbiana presente, garantizando resultados más fiables para la detección de hot spots.
Pero ¿por qué es clave en el contexto metagenómico? En la metagenómica dirigida al 16S, todo comienza por la cantidad y calidad del ADN recuperado. Si las esponjas utilizadas no capturan suficiente biomasa microbiana, el análisis puede fallar y provocar baja profundidad de secuenciación efectiva, datos poco representativos de la microbiota real y existe riesgo de no detectar patógenos persistentes de baja abundancia, los famosos falsos negativos.
No obstante, gracias a su alta capacidad de arrastre y su diseño pensado para la liberación eficiente de microorganismos, las esponjas de muestreo de superficie maximizan el rendimiento del análisis microbiologico. Algo, sin duda, primordial para comparar de forma fiable zonas limpias vs. zonas con contaminación crónica. Aunque, también, para visualizar estructuras de biofilm y comunidades resistentes, así como guiar de manera más precisa medidas correctivas y rediseños de limpieza
Así pues, una estrategia eficaz contra los hot spots microbianos empieza con datos fiables, y esos datos dependen de un muestreo de superficies riguroso. De ahí que las esponjas HiEnviro-Sponge™ pisen con tanta fuerza en nuestro sector, ya que cumplen con los estándares más estrictos de la industria, ofreciendo a los responsables de calidad y seguridad alimentaria una herramienta de gran valor para proteger la inocuidad de los alimentos.
Si estás interesado/a en las esponjas de muestreo de superficies, no dudes en ponerte en contacto con nosotros. ¡Te daremos la información que necesitas y te asesoraremos sobre qué referencia es la más adecuada para tu muestreo!